MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome II

Total Repeats: 17009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016945	AGA	2	6	1142	1147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743461
2	NC_016945	TTG	2	6	1264	1269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743461
3	NC_016945	TGAT	2	8	1336	1343	25 %	50 %	25 %	0 %	379743461
4	NC_016945	CAG	2	6	1377	1382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743461
5	NC_016945	AGC	2	6	1391	1396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743461
6	NC_016945	CAAA	2	8	1415	1422	75 %	0 %	0 %	25 %	379743461
7	NC_016945	GCTG	2	8	1445	1452	0 %	25 %	50 %	25 %	379743461
8	NC_016945	CCAA	2	8	1483	1490	50 %	0 %	0 %	50 %	379743461
9	NC_016945	AAAAGC	2	12	1546	1557	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	379743461
10	NC_016945	TCAA	2	8	1585	1592	50 %	25 %	0 %	25 %	379743461
11	NC_016945	GCCA	2	8	1625	1632	25 %	0 %	25 %	50 %	379743461
12	NC_016945	CAT	2	6	1790	1795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743461
13	NC_016945	CGA	2	6	1802	1807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743461
14	NC_016945	TGA	2	6	1810	1815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743461
15	NC_016945	TTTG	2	8	1817	1824	0 %	75 %	25 %	0 %	379743461
16	NC_016945	ATC	2	6	1855	1860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743461
17	NC_016945	GAT	2	6	1866	1871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743461
18	NC_016945	CAAA	2	8	1897	1904	75 %	0 %	0 %	25 %	379743461
19	NC_016945	CGC	2	6	1906	1911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743461
20	NC_016945	TC	3	6	1928	1933	0 %	50 %	0 %	50 %	379743461
21	NC_016945	A	6	6	1944	1949	100 %	0 %	0 %	0 %	379743461
22	NC_016945	GC	3	6	2091	2096	0 %	0 %	50 %	50 %	379743461
23	NC_016945	T	6	6	2190	2195	0 %	100 %	0 %	0 %	379743461
24	NC_016945	ATT	2	6	2215	2220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379743461
25	NC_016945	ACA	2	6	2249	2254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379743461
26	NC_016945	TCG	2	6	2300	2305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743461
27	NC_016945	ATG	2	6	2319	2324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743461
28	NC_016945	TCG	2	6	2399	2404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743461
29	NC_016945	TC	3	6	2405	2410	0 %	50 %	0 %	50 %	379743461
30	NC_016945	GAAGG	2	10	2412	2421	40 %	0 %	60 %	0 %	379743461
31	NC_016945	GTG	2	6	2496	2501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743461
32	NC_016945	ATGTG	2	10	2522	2531	20 %	40 %	40 %	0 %	379743461
33	NC_016945	ACC	2	6	2562	2567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379743461
34	NC_016945	CAT	2	6	2657	2662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743461
35	NC_016945	TGA	2	6	2762	2767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743461
36	NC_016945	TCA	2	6	2856	2861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743461
37	NC_016945	AGA	2	6	2867	2872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743461
38	NC_016945	GT	3	6	2873	2878	0 %	50 %	50 %	0 %	379743461
39	NC_016945	GCT	2	6	2948	2953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743461
40	NC_016945	ACA	2	6	2962	2967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379743461
41	NC_016945	TCGA	2	8	2991	2998	25 %	25 %	25 %	25 %	379743461
42	NC_016945	AGATG	2	10	3086	3095	40 %	20 %	40 %	0 %	379743461
43	NC_016945	ATC	2	6	3360	3365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743462
44	NC_016945	TGAGAT	2	12	3415	3426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743462
45	NC_016945	CCAC	2	8	3430	3437	25 %	0 %	0 %	75 %	379743462
46	NC_016945	GCG	2	6	3529	3534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743462
47	NC_016945	CAG	2	6	3634	3639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743462
48	NC_016945	GCTTT	2	10	3646	3655	0 %	60 %	20 %	20 %	379743462
49	NC_016945	GCA	2	6	3727	3732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743462
50	NC_016945	TGA	2	6	3754	3759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743462
51	NC_016945	GT	3	6	3763	3768	0 %	50 %	50 %	0 %	379743462
52	NC_016945	TTCA	2	8	3783	3790	25 %	50 %	0 %	25 %	379743462
53	NC_016945	ATC	2	6	3805	3810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743462
54	NC_016945	A	7	7	3811	3817	100 %	0 %	0 %	0 %	379743462
55	NC_016945	ATG	2	6	4176	4181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743463
56	NC_016945	CAA	2	6	4198	4203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379743463
57	NC_016945	GAA	2	6	4217	4222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743463
58	NC_016945	CAA	2	6	4239	4244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379743463
59	NC_016945	TTG	2	6	4340	4345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743463
60	NC_016945	ACTG	2	8	4534	4541	25 %	25 %	25 %	25 %	379743464
61	NC_016945	A	7	7	4548	4554	100 %	0 %	0 %	0 %	379743464
62	NC_016945	CTT	2	6	4578	4583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743464
63	NC_016945	AAGC	2	8	4601	4608	50 %	0 %	25 %	25 %	379743464
64	NC_016945	GAA	2	6	4815	4820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743465
65	NC_016945	CGG	2	6	4918	4923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743465
66	NC_016945	A	6	6	4973	4978	100 %	0 %	0 %	0 %	379743465
67	NC_016945	ACCA	2	8	5046	5053	50 %	0 %	0 %	50 %	379743465
68	NC_016945	TGG	2	6	5077	5082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743465
69	NC_016945	TACC	2	8	5125	5132	25 %	25 %	0 %	50 %	379743465
70	NC_016945	CA	3	6	5193	5198	50 %	0 %	0 %	50 %	379743465
71	NC_016945	GAT	2	6	5234	5239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743465
72	NC_016945	GAA	2	6	5240	5245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743465
73	NC_016945	TGA	2	6	5262	5267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743465
74	NC_016945	GACA	2	8	5284	5291	50 %	0 %	25 %	25 %	379743465
75	NC_016945	TTC	2	6	5339	5344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743465
76	NC_016945	TGT	2	6	5428	5433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743465
77	NC_016945	CAG	2	6	5498	5503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743465
78	NC_016945	AAT	2	6	5526	5531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379743465
79	NC_016945	GAT	2	6	5849	5854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743466
80	NC_016945	GCA	2	6	5859	5864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743466
81	NC_016945	GATC	2	8	5917	5924	25 %	25 %	25 %	25 %	379743466
82	NC_016945	GCG	2	6	5966	5971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743466
83	NC_016945	TGG	2	6	6010	6015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743466
84	NC_016945	CAT	2	6	6046	6051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743466
85	NC_016945	GTG	2	6	6054	6059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743466
86	NC_016945	GGCAG	2	10	6133	6142	20 %	0 %	60 %	20 %	379743466
87	NC_016945	GC	3	6	6148	6153	0 %	0 %	50 %	50 %	379743466
88	NC_016945	TC	3	6	6196	6201	0 %	50 %	0 %	50 %	379743466
89	NC_016945	TGG	2	6	6249	6254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743466
90	NC_016945	GGCT	2	8	6274	6281	0 %	25 %	50 %	25 %	379743466
91	NC_016945	CG	3	6	6299	6304	0 %	0 %	50 %	50 %	379743466
92	NC_016945	GATT	2	8	6343	6350	25 %	50 %	25 %	0 %	379743466
93	NC_016945	GAT	2	6	6352	6357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743466
94	NC_016945	GCT	2	6	6506	6511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743466
95	NC_016945	GC	3	6	6636	6641	0 %	0 %	50 %	50 %	379743467
96	NC_016945	CCG	2	6	6713	6718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743467
97	NC_016945	TGCTC	2	10	6776	6785	0 %	40 %	20 %	40 %	379743467
98	NC_016945	ATA	2	6	6820	6825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379743467
99	NC_016945	T	6	6	6845	6850	0 %	100 %	0 %	0 %	379743467
100	NC_016945	GTA	2	6	6886	6891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743467
101	NC_016945	TG	3	6	6963	6968	0 %	50 %	50 %	0 %	379743467
102	NC_016945	CG	3	6	7057	7062	0 %	0 %	50 %	50 %	379743467
103	NC_016945	GAG	2	6	7086	7091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379743467
104	NC_016945	GCT	2	6	7173	7178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743467
105	NC_016945	CTT	2	6	7190	7195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743467
106	NC_016945	GAGC	2	8	7213	7220	25 %	0 %	50 %	25 %	379743467
107	NC_016945	GTCG	2	8	7245	7252	0 %	25 %	50 %	25 %	379743467
108	NC_016945	ATT	2	6	7287	7292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379743467
109	NC_016945	GTT	2	6	7296	7301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743467
110	NC_016945	TCTCT	2	10	7358	7367	0 %	60 %	0 %	40 %	379743467
111	NC_016945	TGC	2	6	7435	7440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743467
112	NC_016945	TTGA	2	8	7446	7453	25 %	50 %	25 %	0 %	379743467
113	NC_016945	ATG	2	6	7462	7467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743467
114	NC_016945	CT	3	6	7477	7482	0 %	50 %	0 %	50 %	379743467
115	NC_016945	TGCG	2	8	7541	7548	0 %	25 %	50 %	25 %	379743467
116	NC_016945	ATG	2	6	7612	7617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743467
117	NC_016945	ATT	2	6	7630	7635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379743467
118	NC_016945	AGC	2	6	7663	7668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743467
119	NC_016945	GCCA	2	8	7674	7681	25 %	0 %	25 %	50 %	379743467
120	NC_016945	TA	3	6	7685	7690	50 %	50 %	0 %	0 %	379743467
121	NC_016945	GCT	2	6	7703	7708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743467
122	NC_016945	GC	4	8	7714	7721	0 %	0 %	50 %	50 %	379743467
123	NC_016945	ATA	2	6	7851	7856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379743467
124	NC_016945	TCG	2	6	7955	7960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743467
125	NC_016945	TAA	2	6	7968	7973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379743467
126	NC_016945	CAT	2	6	8051	8056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743467
127	NC_016945	CAT	2	6	8142	8147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743467
128	NC_016945	CAT	2	6	8211	8216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743467
129	NC_016945	AAAG	2	8	8245	8252	75 %	0 %	25 %	0 %	379743467
130	NC_016945	CAT	2	6	8559	8564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743468
131	NC_016945	CAA	2	6	8584	8589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379743468
132	NC_016945	CAA	2	6	8592	8597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379743468
133	NC_016945	GCC	2	6	8612	8617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743468
134	NC_016945	AGCA	2	8	8716	8723	50 %	0 %	25 %	25 %	379743468
135	NC_016945	TC	3	6	8771	8776	0 %	50 %	0 %	50 %	379743468
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